ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาต้านไวรัส โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชสำหรับการปรับปรุงประสิทธิภาพยาและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ใช้กันทั่วไปในการเตรียมส่วนประกอบยาที่ออกฤทธิ์ (APIs) โดยแกน pyrimidine ช่วยในการจับกับเป้าหมาย โดยเฉพาะในงานวิจัยมะเร็งและต้านไวรัส นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในสารเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพในพืชพาหะเชื้อโรค