ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างยาที่มีฐานไพรีมีดีน นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพในเส้นทางเมแทบอลิซึม