ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์ยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยเฉพาะในการพัฒนานิวคลีโอไซด์อะนาล็อก โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงเบสไพรีมีดีนได้อย่างเลือกสรร โดยเฉพาะหมู่ไซโตซีนที่ถูกดัดแปลง ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการสร้างโปรดรักและโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์เปปไทด์และนิวคลีโอไทด์แบบเฟสของแข็งและแบบละลาย เนื่องจากกลุ่มอะมีนที่ป้องกันด้วย Boc ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาคัปปลิ้งที่ควบคุมได้ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมนิวคลีโอไทด์ที่ติดฉลากสำหรับการทดสอบทางชีวเคมีและการใช้งานด้านการวินิจฉัย รวมถึงสารยับยั้งเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการจำลองตัวของไวรัส เช่น ยาต้านไวรัสเอชไอวีหรือไวรัสตับอักเสบ