ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างนิวคลีโอไซด์แอนะล็อก ซึ่งสามารถรบกวนการจำลองตัวของไวรัสหรือการเจริญเติบโตของเซลล์ผิดปกติ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อปรับเปลี่ยนโมเลกุลเบสไพรีมีดีนให้มีประสิทธิภาพการดูดซึมทางชีวภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมายที่ดีขึ้น นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในงานวิจัยเพื่อสร้างอนุพันธ์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้