4,6-บิส(3,5-ไดคลอโรฟีนิล)-2-เมทิลไพรีมีดีน ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารกำจัดเชื้อราในกลุ่มสไตรโอบิวโฟลิน (strobilurin) ซึ่งมีประสิทธิภาพสูงในการป้องกันและควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อรา เช่น ราสนิม ราดำ และโรคใบไหม้ ในพืชเศรษฐกิจหลายชนิด เช่น ข้าว ข้าวสาลี มันฝรั่ง และพืชผัก สารสไตรโอบิวโฟลินช่วยยับยั้งการหายใจของเชื้อราที่ระดับไมโทคอนเดรีย ทำให้เชื้อราไม่สามารถผลิตพลังงานได้ ส่งผลให้การเจริญเติบโตหยุดลงและตายในที่สุด เนื่องจากมีความจำเพาะต่อเชื้อราและมีความเป็นพิษต่ำต่อมนุษย์และสิ่งแวดล้อม จึงถูกนำมาใช้ในเกษตรกรรมอย่างแพร่หลาย โดยเฉพาะในรูปแบบของสารผสมหรือสารประกอบที่ออกฤทธิ์ร่วมกับสารกำจัดเชื้อราชนิดอื่นเพื่อลดการดื้อยา