ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการเป็นยาต้านจุลชีพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อเชื้อแบคทีเรียและจุลินทรีย์ก่อโรคบางชนิด โครงสร้างที่มีพิริมิดีนและพิเพอราซีนทำให้มีความเหมาะสมในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ผ่านกลไกการยับยั้งเอนไซม์สำคัญในจุลชีพ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารอนุพันธ์สำหรับงานวิจัยด้านเภสัชกรรม โดยเฉพาะการค้นหาโมเลกุลใหม่ที่มีฤทธิ์ต้านมะเร็งหรือโรคอักเสบ เนื่องจากกลุ่มไนโตรและคลอโรช่วยเพิ่มความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ