ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อน ใช้บ่อยในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น ซูซูกิหรือเนกิชิ เพื่อนำกลุ่มอาริลหรืออัลคิลเข้าไปในกระบวนการค้นพบยา นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมีเกษตรสำหรับออกแบบส่วนผสมออกฤทธิ์ใหม่ที่มีกิจกรรมกำจัดศัตรูพืชหรือวัชพืช ตัวแทนฮาโลเจนให้จุดสำหรับการดัดแปลงเคมีเพิ่มเติม ทำให้สามารถปรับปรุงเส้นทางสังเคราะห์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างสารที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งมีบทบาทในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านจุลชีพ และยาในกลุ่มสารยับยั้งเอนไซม์