ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายากินาเส (kinase inhibitors) และยาต้านไวรัส โครงสร้างไพรีมีดีนที่มีฮาโลเจนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาครอส-คัปพลิงแบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโมเลกุลยาที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยา Suzuki และ Buchwald-Hartwig เพื่อนำเข้าหมู่อะริลหรืออะมิโน นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพในสิ่งมีชีวิตเป้าหมายได้