ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างพิริมิดีน ซึ่งเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาในกลุ่มยับยั้งเอนไซม์ เช่น ยาต้านไวรัส หรือยาต้านจุลชีพ นิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะสารที่ต้องการคุณสมบัติในการออกฤทธิ์ต่อระบบชีวโมเลกุลในเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวกลางในการสร้างอนุพันธ์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพสูง โดยการเติมหมู่ฟังก์ชันอื่นเข้าไปที่ตำแหน่งของอะมิโนหรือบรอมีน