ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยารักษามะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อสร้างยาที่มีฐานพิริมิดีน นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงและวัชอุทิศใหม่ เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับระบบเอนไซม์เฉพาะในพยาธิและศัตรูพืช โดยโครงสร้างที่มีหมู่อะมิโนและคลอโรช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อเนื่องได้หลากหลาย