2-(Methylthio)pyrimidine-5-carbonitrile ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม เนื่องจากโครงสร้างที่เฉพาะเจาะจงและความสามารถในการทำปฏิกิริยา โดยส่วนใหญ่ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อนมากขึ้น เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและสารเคมีทางการเกษตร เนื่องจากมีคุณสมบัติที่ช่วยยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อโรคและแมลงได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาวิจัยเพื่อนำไปใช้ในกระบวนการสังเคราะห์วัสดุใหม่ ๆ ที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น วัสดุที่มีความไวต่อแสงหรือความร้อน ซึ่งสามารถนำไปประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์และพลังงานได้อีกด้วย