ใช้ในการวิจัยเภสัชกรรม 5-(Trifluoromethyl)pyrimidin-2-amine ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารชีวภาพต่างๆ หมู่ไตรฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของโมเลกุลยา ทำให้มีคุณค่ากในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังใช้ในสารเคมีเกษตรเพื่อสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของสารนี้ยังช่วยเหลือในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยเฉพาะในการออกแบบพอลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบที่มีคุณสมบัติเฉพาะ ความหลากหลายของมันทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในเคมีทางการแพทย์และเคมีอุตสาหกรรม นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายาเพื่อรักษาโรคทางระบบประสาทและโรคที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบ เนื่องจากมีคุณสมบัติในการยับยั้งเอนไซม์บางชนิดที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการเหล่านี้