5-Formyl-2-pyrimidinecarbonitrile ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางยาและสารตั้งต้นสำหรับการผลิตยา เนื่องจากโครงสร้างของมันมีทั้งหมู่ฟอร์มิลและไนไตรล์ ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเคมีที่หลากหลาย เช่น ปฏิกิริยาคอนเดนเซชันและการเกิดสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารต้านมะเร็งและสารต้านไวรัส เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพได้