สารเคมีนี้มีการใช้งานหลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือเส้นทางเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการดำเนินโรค นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษากลไกทางชีวเคมีของอนุพันธ์ไพรีมีดีน ซึ่งช่วยในการค้นพบยารักษาใหม่ๆ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่เคมีเกษตร ที่ซึ่งมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารประกอบที่ปกป้องพืชผลจากศัตรูพืชหรือโรค