2-Bromo-4-methoxy-5-methylpyridine ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในการผลิตสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เช่น ยาและสารเคมีทางการเกษตร เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่โบรโมและเมทอกซีทำให้สามารถเกิดปฏิกิริยาเคมีได้หลากหลาย เช่น ปฏิกิริยาแทนที่หรือการเชื่อมต่อกับโมเลกุลอื่นๆ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายาเพื่อศึกษากลไกการออกฤทธิ์หรือปรับปรุงประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพอีกด้วย