(2,3-dimethoxypyridin-4-yl)methanol ใช้ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาความผิดปกติทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนเนื่องจากกลุ่มฟังก์ชันที่ทำปฏิกิริยาได้ การประยุกต์ใช้ขยายไปยังสาขาเคมียารักษา ซึ่งช่วยในการออกแบบและปรับปรุงผู้สมัครยาที่มีประสิทธิภาพและโปรไฟล์ความปลอดภัยที่ดีขึ้น