Ethyl 6-cyanopicolinate ใช้เป็นสารกลางหลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี เป็นส่วนประกอบสำคัญในการผลิตยาสำคัญทางเภสัชกรรม (APIs) และสารเคมีเกษตร เนื่องจากมีปฏิกิริยาที่หลากหลาย สารนี้มักใช้ในการพัฒนายาฆ่าหญ้า ยาฆ่าเชื้อรา และยาฆ่าแมลง เพื่อปกป้องพืชผลจากศัตรูพืชและโรคพืช นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งจำเป็นในเคมียารักษาโรคสำหรับสร้างยาที่มีผลทางบำบัด นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อสำรวจปฏิกิริยาเคมีใหม่และเส้นทางสำหรับสร้างสารประกอบใหม่ รวมถึงการสังเคราะห์สารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่ซับซ้อน