5-Bromo-6-chloropicolinonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารออกฤทธิ์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อออกแบบสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะในสาขามะเร็งและโรคติดเชื้อ บทบาทในสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการสร้างลิแกนด์และตัวเร่งปฏิกิริยาที่ใช้ในปฏิกิริยาเคมี