5-Amino-6-methylnicotinonitrile ใช้หลักในอุตสาหกรรมยาเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โดยเฉพาะในสาขาประสาทวิทยาและมะเร็ง นักวิจัยมักใช้ในการเตรียมอนุพันธ์นิโคตินาไมด์ ซึ่งจำเป็นในการออกแบบการรักษาสำหรับภาวะเช่นโรคอัลไซเมอร์และมะเร็งบางชนิด นอกจากนี้ยังเป็นบล็อกก่อสร้างในการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งถูกสำรวจอย่างกว้างขวางสำหรับคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยเกษตรเคมี ที่ซึ่งมันมีส่วนช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่