4-Bromo-6-chloropicolinonitrile ใช้หลัก ๆ ในการสังเคราะห์ยาและเคมีเกษตร สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตส่วนผสมออกฤทธิ์ต่าง ๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อน ในอุตสาหกรรมยา มักใช้ในการสร้างยาที่เล็งเป้าไปยังโรคเฉพาะ โดยเฉพาะในด้านยาต้านไวรัสและยาต้านแบคทีเรีย นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยในการปกป้องพืชผลและเพิ่มประสิทธิภาพการเกษตร ความหลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการประยุกต์ใช้ในการวิจัย ซึ่งใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและการพัฒนาสารประกอบใหม่ ๆ