2,5,6-Trichloro-4-methylnicotinonitrile ใช้หลักในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถพัฒนาโมเลกุลที่เล็งเป้าไปที่ศัตรูพืชเฉพาะเจาะจง ส่งเสริมการป้องกันพืชผล ในอุตสาหกรรมเภสัชภัณฑ์ ถูกนำมาใช้ในการสร้างส่วนประกอบที่ใช้งานได้สำหรับยา โดยเฉพาะยาที่ออกแบบมาเพื่อต่อสู้กับการติดเชื้อแบคทีเรียและเชื้อรา ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาเคมีทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยและพัฒนาในเคมีอินทรีย์ ช่วยให้สามารถสำรวจสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการบำบัดรักษา