2-Methylpyridine-4-sulfonic acid ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ กลุ่มซัลโฟนิกแอซิดของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าตั้งต้นสำหรับสร้างสารประกอบที่มีความละลายและปฏิกิริยาที่ดีขึ้น ในอุตสาหกรรมยา มักใช้ในการผลิตยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังเป็นส่วนประกอบสำคัญในการผลิตสีย้อมและเม็ดสี ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มความเสถียรและคุณสมบัติสีของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ในสารเคมีเกษตร ใช้ในการปรุงสูตรยาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง ช่วยในการส่งและกิจกรรมที่มีประสิทธิภาพของสารประกอบเหล่านี้ ความหลากหลายในการเกิดปฏิกิริยาทางเคมียังทำให้มีประโยชน์ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะ