เมทิลไอโซนิโคตีเนต-เอ็น-ออกไซด์ ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางในการเตรียมสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร ในงานวิจัยเภสัชกรรม มักใช้ในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) เนื่องจากความสามารถในการนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเข้าไปในโครงสร้างโมเลกุล นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษ โดยใช้คุณสมบัติการตอบสนองเพื่อสร้างวัสดุใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะตามต้องการ บทบาทในกระบวนการเหล่านี้เน้นย้ำถึงความสำคัญในการส่งเสริมการนวัตกรรมทางเคมีและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม