6-(Trifluoromethyl)pyridine-2-thiol เป็นสารเคมีที่นิยมใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรเคมี เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลและไทออล ทำให้มีคุณสมบัติทางเคมีที่หลากหลายและมีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์

ในอุตสาหกรรมยา สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีคุณสมบัติทางรักษา โดยกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ ความเสถียรทางเมแทบอลิซึม และประสิทธิภาพของยา นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในกระบวนการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและสารเคมีทางการเกษตรอื่นๆ เช่น ยาฆ่าแมลงและวัชยา เนื่องจากช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและการจัดการความต้านทาน

นอกจากนี้ 6-(Trifluoromethyl)pyridine-2-thiol ยังถูกใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างโพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบผิวที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น ความต้านทานต่อสารเคมีและความทนทาน สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ เพื่ออำนวยความสะดวกในการผลิตโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมต่างๆ และยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกของสารประกอบไนโตรเจนและกำมะถัน