สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาเคมีทางการแพทย์ในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โครงสร้างของมันที่มีทั้งกลุ่มไดฟลูออโรและไนโตร ทำให้เป็นหน่วยย่อยที่มีคุณค่าต่อการพัฒนายาที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้นและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม โดยเฉพาะอย่างยิ่ง มักถูกนำมาใช้ในการสร้างตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางอักเสบหรือมะเร็ง ความสามารถของสารในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพถูกนำมาใช้เพื่อออกแบบโมเลกุลที่มีประสิทธิภาพและความเลือกสรรที่ปรับปรุงแล้วในโปรแกรมค้นพบยา