4-Chloro-3-methylpyridin-2-amine ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพและยา มันมักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการผลิตสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา เช่น ยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อการสร้างยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืช บทบาทของมันในการสังเคราะห์อินทรีย์มีความสำคัญสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน เนื่องจากมีกลุ่มอะมีนและคลอโรที่ทำปฏิกิริยาได้ง่าย ซึ่งอำนวยให้เกิดการแปลงทางเคมีที่หลากหลาย