2-Iodo-6-methylpyridin-3-amine เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลัก ๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มันมักถูกใช้ในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสร้างสารเคมีเกษตร สนับสนุนการปรุงสูตรยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชที่ช่วยเพิ่มการป้องกันพืช พื้นที่โครงสร้างของมัน ซึ่งมีทั้งอะตอมไอโอดีนและกลุ่มอะมีน ทำให้เป็นหน่วยก่อสร้างที่มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น การจับคู่ Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญในการสร้างกรอบอินทรีย์ที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสังเคราะห์โพลิเมอร์เฉพาะหรือลิแกนด์ที่เป็นส่วนสำคัญของระบบเร่งปฏิกิริยา