(6-Bromo-2-methoxypyridin-3-yl)methanamine ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนาด้านเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างโมเลกุลที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ ทำให้มีประโยชน์ในการค้นคว้ายา สารประกอบนี้มักใช้ในการออกแบบตัวแทนบำบัดที่อาจเป็นไปได้ โดยเฉพาะในการพัฒนายาระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเส้นทางทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในการสังเคราะห์โมเลกุลขนาดเล็กสำหรับรักษาโรค เช่น การอักเสบ ปวด หรือโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการวิจัยด้านเกษตรเคมี ซึ่งอาจใช้ในการพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่