5-Bromo-2-chloro-4-iodopyridine ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่กำหนดเป้าหมายโรคทางระบบประสาทและการติดเชื้อ โครงสร้างที่มีฮาโลเจนสูงทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายในเคมีอินทรีย์ สามารถสร้างโมเลกุลซับซ้อนผ่านปฏิกิริยา cross-coupling นอกจากนี้ ยังประยุกต์ใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ ความสามารถในการทำปฏิกิริยาที่มีเอกลักษณ์ยังมีคุณค่าในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการพัฒนาวัสดุอินทรีย์ขั้นสูงและลิแกนด์สำหรับกระบวนการเร่งปฏิกิริยา