3,5-Diiodopyridin-2-amine ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชภัณฑ์ ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลินทรีย์หรือต้านไวรัส อะตอมไอโอดีนของมันทำให้มีประโยชน์ในเภสัชวิทยากัมมันตรังสีสำหรับการถ่ายภาพและวัตถุประสงค์วินิจฉัย นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการศึกษาการยับยั้งเอนไซม์และการจับกับตัวรับเนื่องจากคุณสมบัติโครงสร้าง