3-Bromo-2-methoxy-6-methylpyridine ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งใช้ในการผลิตยาชนิดต่าง ๆ รวมถึงสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ เพื่อศึกษาประสิทธิภาพและความปลอดภัยของสารประกอบทางเคมี นอกจากนี้ยังอาจถูกนำไปใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเพื่อพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชหรือสารปรับปรุงการเจริญเติบโตของพืชอีกด้วย