2-Amino-5-morpholinopyridine ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายา เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างยาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงการรักษาที่มีศักยภาพสำหรับความวิตกกังวลและภาวะซึมเศร้า นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนายับยั้ง kinase ซึ่งสำคัญต่อการบำบัดมะเร็ง ในเคมีอินทรีย์ ใช้ในการสร้างโครงสร้างเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน เพื่อช่วยในการค้นพบตัวแทนบำบัดใหม่ๆ ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการวิจัยเกษตรเคมี ที่ซึ่งช่วยในการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่