2-Amino-3-(morpholinomethyl)pyridine ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่โต้ตอบกับตัวรับเฉพาะเจาะจงในสมอง ช่วยในการรักษาสภาวะเช่น ความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า และความบกพร่องทางความรู้ความเข้าใจ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการผลิตสารเคมีเกษตร สนับสนุนการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชโดยเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะ ในงานวิจัย ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อนสำหรับการศึกษากิจกรรมทางชีวภาพและการค้นพบยา