3-Bromo-2-fluoropyridine ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งรวมอะตอมโบรมีนและฟลูออรีนบนวงแหวนไพรีดิน ทำให้เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการพัฒนาสารประกอบที่ใช้งานได้หลากหลาย ในกระบวนการค้นพบยา มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหลักสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลที่ใช้งานทางชีวภาพ รวมถึงตัวแทนบำบัดที่อาจมีศักยภาพที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคติดเชื้อ การมีอะตอมฮาโลเจนช่วยให้สามารถทำหน้าที่เพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งช่วยให้สร้างสถาปัตยกรรมโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังพบการใช้งานในการเตรียมวัสดุขั้นสูงและลิกานด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยา ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนากระบวนการเคมีที่มีประสิทธิภาพ ประโยชน์ของมันในการวิจัยและการใช้งานอุตสาหกรรมเน้นย้ำถึงความสำคัญในเคมีสังเคราะห์สมัยใหม่