3-Bromo-2,4-difluoropyridine ถูกใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งมีสารย่อยโบรมีนและฟลูออรีน ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีค่าในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการสร้างยาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง มะเร็ง และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการพัฒนายาฆ่าแมลงและวัชยาใหม่ๆ โดยใช้ประโยชน์จากปฏิกิริยาของมันในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ในวิทยาศาสตร์วัสดุ มันถูกใช้ในการสังเคราะห์วัสดุอินทรีย์ขั้นสูง รวมถึงผลึกเหลวและโพลิเมอร์ เนื่องจากความสามารถในการนำเสนอคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์และ steric เฉพาะ ความหลากหลายในการทำปฏิกิริยาครอสคัปปลิ้งยังทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างสถาปัตยกรรมโมเลกุลที่ซับซ้อน