4,6-Dimethylpicolinic acid hydrochloride ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่าง ๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาทและการอักเสบ มันมีบทบาทในการผลิตสารกำจัดวัชพืช ช่วยในการควบคุมพืชที่ไม่ต้องการในพื้นที่เกษตร นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์สำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างลิแกนด์และตัวเร่งปฏิกิริยา คุณสมบัติของมันทำให้มีคุณค่าในการศึกษาวิทยาศาสตร์การประสานและโครงสร้างโลหะ-อินทรีย์