3-Iodo-2-methoxyisonicotinonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นที่หลากหลายในการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มไอโอโดและกลุ่มไนไตรล์ ทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง เช่น Suzuki-Miyaura และ Sonogashira couplings ซึ่งจำเป็นต่อการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร นอกจากนี้ กลุ่มเมทอกซี่ยังช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความเลือกสรรในการแปลงเคมีต่างๆ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์ในการเคมียารักษาเพื่อออกแบบยาตัวสมุคร การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ โดยสามารถใช้ในการสังเคราะห์วัสดุอินทรีย์ขั้นสูงที่มีศักยภาพในการใช้งานอิเล็กทรอนิกส์และโฟโตอิเล็กทรอนิกส์