5-Bromo-4-chloronicotinic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม ในด้านเภสัชกรรม มันถูกนำมาใช้ในการผลิตยาต้านจุลชีพและยาต้านไวรัส เนื่องจากโครงสร้างที่สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการพัฒนายาชนิดใหม่ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารประกอบต่างๆ ในด้านเกษตรกรรม สารนี้มีศักยภาพในการพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชหรือสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการผลิตทางการเกษตร