2-Amino-3-chloro-6-methoxypyridine ถูกใช้หลักๆ เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) มันมักถูกใช้ในการสร้างสารประกอบที่มีคุณสมบัติบำบัด เช่น ยาต้านไวรัส ต้านแบคทีเรีย หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการเตรียมสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง สนับสนุนการพัฒนาผลิตภัณฑ์ป้องกันพืชที่มีประสิทธิภาพ ความยืดหยุ่นในการสังเคราะห์อินทรีย์ทำให้มีคุณค่าในงานวิจัยและอุตสาหกรรมสำหรับพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ