เมทิล 5-ฟีนิลนิโคติเนต ถูกใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนายาต่างๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โครงสร้างของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีคุณสมบัติบำบัด โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ยาที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกทางเคมี สนับสนุนความก้าวหน้าในเคมียารักษาโรค ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการพัฒนาสารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสร้างสารประกอบที่เพิ่มการป้องกันพืชและผลผลิต