6-Bromo-5-fluoropyridin-2-amine ใช้เป็นหลักในการวิจัยและพัฒนาด้านเภสัชกรรม สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลที่มีคุณสมบัติทางบำบัดที่เป็นไปได้ โดยเฉพาะในด้านมะเร็งวิทยาและประสาทวิทยา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารเคมีทางการเกษตร ซึ่งช่วยในการกำหนดสูตรยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ ความตอบสนองและกลุ่มฟังก์ชันของสารประกอบนี้ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์แบบออร์แกนิก สามารถช่วยในการสร้างโครงสร้างทางเคมีที่ซับซ้อน