6-Chloro-2-(difluoromethyl)-3-fluoropyridine เป็นสารเคมีที่ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือเส้นทางเฉพาะในวัชพืชและศัตรูพืช เพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์ป้องกันพืชผล นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยเภสัชกรรม ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มีคุณสมบัติบำบัดที่เป็นไปได้ กลุ่มฟลูออรีนในโครงสร้างช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมในชีวภาพในโมเลกุลยา