6-Fluoro-N-methylpyridin-3-amine ถูกใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสันและอัลไซเมอร์ เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนตัวรับเฉพาะในสมอง นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสร้างสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการปรุงสูตรยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ซึ่งคุณสมบัติโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรร โมเลกุลฟลูออรีนของมันมีส่วนช่วยในการปรับปรุงเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าในการวิจัยเคมียารักษาโรค