6-(Trifluoromethyl)pyridine-2,3-diamine ใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญต่างๆ (APIs) หมู่ไตรฟลูออโรเมทิลของมันช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง การอักเสบ และโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โดยใช้โครงสร้างทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความเข้ากันได้กับสิ่งแวดล้อม