6-Morpholinonicotinic acid ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งวงแหวน morpholine และส่วนของ nicotinic acid ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชที่ช่วยเพิ่มการป้องกันพืช นักวิจัยยังสำรวจศักยภาพของมันในการออกแบบวัสดุใหม่และตัวเร่งปฏิกิริยา เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์