เมทิล 5-อะมิโน-4,6-ไดบรอมโมพิโคลิเนต ถูกนำมาใช้หลัก ๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันที่มีทั้งหมู่อะมิโนและบรอมโมทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์ส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) สารประกอบนี้มักถูกใช้ในการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งมีความสำคัญในออกแบบยาเนื่องจากมีกิจกรรมทางชีวภาพที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ ๆ โดยใช้ความตอบสนองของมันในการสร้างสารประกอบที่สามารถกำหนดเป้าหมายเส้นทางชีวภาพเฉพาะในศัตรูพืชหรือวัชพืช บทบาทของมันในวิทยาศาสตร์วัสดุก็คุ้มค่าที่จะกล่าวถึง เนื่องจากสามารถนำไปรวมในการสังเคราะห์วัสดุขั้นสูงที่มีการประยุกต์ใช้ที่เป็นไปได้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์หรือสารเคลือบผิว