5-Amino-2-chloroisonicotinamide ถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในด้านการออกแบบและสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาโรค มันมักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งอาจมีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น การต้านมะเร็ง การต้านเชื้อแบคทีเรีย หรือการต้านไวรัส นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการใช้งานในด้านเคมีเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพและความปลอดภัยสูง