5-Ethynylpyridine-3-carboxylic acid ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชกรรม มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงยาที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท กลุ่มฟังก์ชันเอทินิลและกรดคาร์บอกซิลิกช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนทางเคมีได้หลากหลาย ส่งเสริมการสร้างอนุพันธ์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับออกแบบโพลิเมอร์ฟังก์ชันและคอมเพล็กซ์การประสานที่มีคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ที่เป็นเอกลักษณ์ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการเร่งปฏิกิริยา ซึ่งทำหน้าที่เป็นลิแกนด์ในปฏิกิริยาที่เร่งด้วยโลหะ