4-Hydroxypicolinaldehyde hydrochloride ใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ กลุ่มอัลดีไฮด์ของมันทำให้เป็นหน่วยย่อยที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ลิแกนด์สำหรับเคมีประสานของโลหะ ซึ่งสำคัญในด้านการเร่งปฏิกิริยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความเสถียรและความละลาย ทำให้ง่ายต่อการใช้ในห้องปฏิบัติการและการประยุกต์ในอุตสาหกรรม