เอทิล 4-อะมิโน-2-คลอโรนิโคติเนต ถูกใช้หลักในฐานะสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสร้างยาต้านไวรัสและยาปฏิชีวนะ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการเกิดปฏิกิริยาเคมีและพัฒนาวิธีการใหม่ๆ ในเคมียารักษาโรค ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีประโยชน์ในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และสารเคมีละเอียดอื่นๆ